Dự án chính thức bắt đầu từ tháng 8/2015 này nhằm nâng cao hơn nữa hoạt động hiệu quả của hệ thống hải quan điện tử mới có tên là VNACCS/VCIS* và là Dự án tiếp nối cho Dự án hợp tác kỹ thuật hiện tại khép lại trong tháng 7 mang tên “Dự án thúc đẩy hải quan điện tử tại Việt Nam”.
Dự án hợp tác kỹ thuật hiện tại đã được vận hành từ tháng 4/2012 song song cùng với Dự án viện trợ không hoàn lại “Hải quan điện tử và Cơ chế một cửa Quốc gia trong hiện đại hóa hải quan” (3/2012 - 3/2014).
Từ khi hệ thống được đưa vào vận hành (tháng 4/2014), VNACCS/VCIS đã hoạt động ổn định và góp phần tạo thuận lợi thương mại ở Việt Nam. Xấp xỉ 99% số lượng tờ khai xuất nhập khẩu đã được thực hiện thông qua VNACCS. Trong năm đầu tiên triển khai (từ 1/4/2014 đến 31/3 2015), có tổng số 56.000 doanh nghiệp đã nộp tờ khai thông qua hệ thống, tổng số tờ khai vào khoảng 6,74 triệu lượt, tổng doanh thu đạt khoảng 271,5 triệu Đôla Mỹ.
Khảo sát do Tổng cục Hải quan Việt Nam kết hợp với Phòng Thương mại và Công nghiệp Việt Nam tiến hành tại một Chi cục Hải quan tại TP. HCM hồi tháng 10/2014 đã chứng minh rằng với việc áp dụng hệ thống VNCCS/VCIS, thời gian thông quan nhập khẩu và xuất khẩu trung bình đã giảm xuống lần lượt 18% và 58% so với năm trước, giúp tiết kiệm chi phí trong thương mại quốc tế đối với doanh nghiệp.