Hiện nay, phí môi trường đang tính cho xăng E5 thấp hơn phí môi trường xăng khoáng 100%. Bộ Công Thương, xuất phát từ đề nghị của rất nhiều bên đang báo cáo Chính phủ tiếp tục giảm phí môi trường của sản phẩm thân thiện với môi trường là xăng E5. Đây chính là cơ sở tạo độ chênh về giá.
Nhiều nước áp dụng ưu đãi về thuế, phí để khuyến khích sản phẩm thân thiện môi trường. Giữa xăng khoáng RON 92 và xăng E5, Chính phủ đã dùng chính sách thuế phí để tạo độ chênh. Thời điểm chênh cao nhất khoảng 1.000 đồng/lít, có lúc chỉ còn 300 đồng/lít và bình quân 500 đồng/lít. Khi giá xăng khoảng 15.000 đồng/lít, nếu giảm 500 đồng thì giảm được khoảng 3,3%.
Ngoài ra, kể cả trong thời điểm tồn tại giữa xăng RON 92 và xăng RON 95, khoảng chênh giữa hai loại xăng này đã là 700 – 800 đồng/lít. Tuy nhiên, đây là hai loại xăng đạt tiêu chuẩn EURO 2. Hiện tại, xăng RON 95 mà dư luận đang cho rằng giá cao đột biến là xăng tiêu chuẩn EURO 3, EURO 4. Nhiên liệu này tại các nước khác cũng được bán với giá cao hơn. Do đó, so sánh xăng RON 95 hiện nay và E5 là không cùng hệ và không hợp lý.